生物信息学数据库的产生 生物信息学专业MySQL数据库课程教学方法探讨

生物信息学专业MySQL数据库课程教学方法探讨

关键词：MySQL数据库生物信息学 中图分类号：G64文献标识码：A文章编号：1674-098X（2016）02 （b）-0141-02 随着计算机技术和生物技术的快速发展，MySQL数据库课程不仅是 计算机类专业、信息管理专业的重要专业课程，也是生物信息学专业的必修课程。

MySQL数据库作为应用型课程，其课程体系注重培养学生利用数据库技术解决 实际问题的能力，然而由于专业方向、教学手段、考核方式等方面的限制，容易 使学生学习目标不明确、缺乏学习兴趣，导致学习效果较差。如何改变生物信息 学专业的MySQL数据库教学现状，是值得深入思考的问题，该文从教学实践出 发，探讨MySQL数据库课程在生物信息学专业中的重要性和教学方法。

1MySQL数据库特点 MySQL由瑞典MySQLAB公司开发的一款开放源码的中小型关系数 据库管理系统，是当前网站开发中尤其是PHP开发中使用最为广泛的数据库。

MySQL支持多线程充分利用CPU资源，提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多种数据 库连接途径，支持Linux、Solaris和Windows等多种操作系统，使用系统核心提供 的多线程机制提供完全的多线程运行模式，提供了面向C、C++、Java、Perl、PHP 和Python等编程语言接口，优化SQL查询算法，可有效地提高查询速度。它具有 操作简单、体积小、速度快等优点，语法简单，容易被学生理解和接受，在编写 网站应用程序时，几乎离不开数据库，所以，在教学中选取MySQL作为教学用 数据库管理系统。

2MySQL数据库课程教学方法研究 MySQL数据库具有很多特点，是网站应用程序不可缺少的重要部分。对于生物信息学专业的学生而言，使用很多数据库，如，NCBI、UCSC等进行生 物数据检索，而获得数据后，如何进行数据存储、数据处理和分析成为一个重点 难点问题。学习MySQL数据库课程，能使学生快速地掌握使用方法，提高处理 数据效率。为保证良好的MySQL数据库教学效果，从以下几方面开展教学方法 研究和实践。

2.1理论与实践紧密结合，调动学生学习兴趣 根据MySQL数据库理论性和应用性强的特点，为使学生全面掌握数 据库基本知识和技能，提出理论与实践紧密结合的教学方法，重视课堂理论知识 的传授，紧密结合实践训练。例如：理论学习关系数据库模型时，引入实例，指 导学生从GenBank数据库获取核酸和蛋白质序列，调动学生主动思考，如何存储 为关系模型数据，加深学生对关系模型的理解和应用，并为同学分配任务，进行 核酸和蛋白质序列的查询、修改关系操作，通过这种具有专业特色的理论学习与 实践训练相结合的教学方法，使学生掌握了MySQL数据库理论知识的同时，也 激励同学主动开展实践训练，能够使枯燥的理论知识变得生动有趣，使学生认识 到MySQL数据库课程的重要性，进一步促进生物信息学专业课程的学习。

2.2项目与任务驱动结合，培养学生动手能力 针对MySQL数据库课程的特点，开展项目与任务紧密结合的教学方 法。总体上将课程划分为若干阶段的教学过程，并将教学过程分解在一个项目案 例MySQL数据库系统中。例如：构建人类疾病相关基因数据库系统，将该项目 划分按照数据库设计周期划分为以下6个阶段：需求分析阶段、概念结构设计阶 段、逻辑结构高设计阶段、物理结构设计阶段，数据库实施阶段和数据库运行与 维护阶段，分配子项目和子任务，包括人类疾病相关基因数据的获得与处理、转 化为关系模型结构数据、数据模式分解、MySQL数据库构建、关系表构建、数 据类型设置、数据导入、创建索引、视图、触发器以及存储过程等，充分调动学 生学习的主动性，发挥主观能动性，用项目和任务引导学生学习知识点，即把知 识点的讲授贯穿在实际应用项目的开发过程之中，指导学生掌握实际的MySQL 数据库的分析、设计与开发过程，培养学生动手研发能力。

2.3考核与教学反思结合，优化教学内容 目前，MySQL的数据库课程理论与实践考核存在考核过程效率低、 考核内容覆盖面小、考核方法少等问题使教师难以全面掌握学生的学习效果，所以，在考核过程中督促学生全面掌握数据库相关知识，提出了可靠的理论与实践 考核方法，即制订合理的考核内容计划，构建全面的数据库、试题库、理论试题 库和实践试题库，全面覆盖表与数据库的创建、表结构的修改及索引的创建、数 据操作、查询及视图、触发器与存储过程的创建、用户与权限管理等，结合生物 信息学专业知识进行理论和实践考试，保证理论考试和实践考试能够全面真实地 反映学生的掌握水平。同时，进行教学反思，即时纠正教学过程中还存在的问题， 对于课堂上学生提出的一些独特见解给予充分肯定，推广的好方法、好思路、好 见解，完善教学过程，拓宽教师的教学思路，提高教学水平。

3结语 MySQL数据库课程是生物信息学专业的重要专业基础课，具有较强 的应用性。该文根据MySQL数据库特点，结合生物信息学专业特色，提出了理 论与实践结合、项目与任务结合、考核与教学反思结合的教学方法，不仅调动学 生的学习主动性，而且在实践过程中使学生充分认识到MySQL数据库课程在生 物信息学数据存储、数据处理等方面的重要作用，通过数据库试题库进行理论与 实践考核，督促学生全面掌握数据库相关知识，通过项目与任务结合培养了学生 的实践能力，很好地完成了教学任务，但具体教学过程中可能还会存在一些问题， 这需要教师根据课程环境进行即时调整不断地完善，使MySQL数据库课程在生 物信息学专业中发挥更重要的作用。

作者：崔颖等